RIP-seq方法研究miRNA靶标(附高分案例)
研究表明JNK/miR-31/Cdc42的反馈调节在维持肝细胞稳态中具有重要作用。运用RIP-seq检测技术,发现miR-31通过结合并抑制Cdc42的表达和活性,抑制JNK的激活,从而缓解肝细胞损伤。因此可以推测,miR-31可能具备作为药物传递分子来增强药物对抗APAP诱导的DILI的治疗潜力。
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研究表明JNK/miR-31/Cdc42的反馈调节在维持肝细胞稳态中具有重要作用。运用RIP-seq检测技术,发现miR-31通过结合并抑制Cdc42的表达和活性,抑制JNK的激活,从而缓解肝细胞损伤。因此可以推测,miR-31可能具备作为药物传递分子来增强药物对抗APAP诱导的DILI的治疗潜力。
本文的研究揭示了:1)CPR5是一个SR家族RNA结合蛋白;2)RNA剪接因子NTC和RNA poly(A)加尾因子CPSF协同调控植物免疫;3) CPR5将RNA加工和植物免疫两大基本的生命过程联系起来
目前,大量研究已经证实m6A修饰具有重要功能:在分子功能层面,m6A修饰影响RNA的转录、加工、运输、翻译、降解等一系列过程(Yang et al., 2018);在生物学功能层面,m6A修饰参与调控生长发育、细胞分化、癌症发生发展等生物学过程。
Poly(A)-seq技术的方便性和稳定性会带给全球许多实验室新的机遇,推动一批创新性优秀成果的产出。我们希望我们团队提供的Poly(A)-seq技术服务可以惠及全国科研院所和医院的多个研究团队,助力各团队抓住这个新的科研机遇,产生创新性研究成果,实现新的突破。
首先,通过构建IGF2BP2敲除的巨噬细胞,探索炎症诱导下,IGF2BP2敲除对M1和M2型巨噬细胞激活的影响;
其次,通过iRIP-seq等实验明确了IGF2BP2在巨噬细胞表型激活中的作用机制;
最后,通过建立结肠炎和哮喘小鼠模型,利用小鼠的骨髓细胞交叉移植等实验,验证了IGF2BP2在炎症疾病中的功能。
运用ChIRP-MS和RNA pull down检测技术,发现lncRNA PFI通过结合并抑制剪接因子SRSF1的表达和活性,抑制EDA + Fn1剪接异构体的产生,从而参与肺纤维化的调控。因此可以推测,诱导PFI表达可能为预防和治疗PF提供一种新的途径。
作者揭示了细胞骨架蛋白MACF1调控成骨细胞分化的机制。当细胞内MACF1水平较高时,MACF1会与细胞骨架及微管蛋白结合,从而有效的隔离了细胞质中成骨分化相关的抑制因子,确保了成骨细胞的动态分化过程。当细胞内MACF1降低时,成骨分化相关抑制因子会核易位进入细胞核中,从而抑制成骨分化相关基因的转录(
这项研究表明了选择性剪接在塑造低等真核生物的转录组和蛋白质组复杂性中的普遍作用。结合数十种复杂的可变剪接模式的鉴定,可变剪接机制在黄萎病菌中具有重要的作用。黄萎病菌不同AS模式的频率和分布与通过EST分析或转录组测序检测到的拟南芥和水稻的AS频率和分布惊人地相似,按高低排序为IR,A3SS,A5SS和ES。在可变剪接调控的基因的功能聚类表明,在真菌发育和繁殖,信号转导,线粒体软骨功能以及许多其他生物学功能(包括转录和转录后过程)中可变剪接发挥着关键作用