转录组测序分析可变剪接轻松上6分-快来抄作业

这项研究利用转录组测序技术揭示了不同时期慢性髓系白血病患者的转录图谱。运用ABLas可变剪接分析流程比较了两类患者中的可变剪接调控模式,急变期白血病患者表现出更显著的剪接失调。筛选出辅助剪接因子hnRNPA1可作为区分白血病患者和健康人的的生物标志物。实验证明hnRNPA1的全长剪接亚型A1-b在急变期患者中表达明显升高,这种独特的表达模式可能为白血病急慢性患者的分类提供新的预后指标。

【最新!胃癌的单细胞测序研究】成纤维细胞在调节肿瘤微环境中的独特作用

通过8名胃癌患者的癌组织和癌旁粘膜组织进行单细胞转录组测序,解析了胃癌肿瘤微环境中CAFs的分类、功能、起源及与其他细胞亚群的相互作用,并进一步验证CAFs在不同病理类型中的空间分布。这些结果揭示了CAFs在调节肿瘤微环境中的独特作用,参与免疫调节、侵袭、迁移和血管生成等过程。值得注意的是,胃癌中eCAF趋化能力增强,促进了M2巨噬细胞的招募,并与胃癌患者预后不良有关,表明抑制eCAF激活可能是胃癌患者潜在的治疗靶点。

单细胞 RNA 测序揭示人类胆囊癌进展的多样性和瘤内异质性

本研究利用单细胞RNA-seq技术揭示了胆囊癌进展过程中多细胞群广泛的重编程,通过对正常、原发和淋巴结转移肿瘤组织的细胞亚型的全面描述揭示了细胞的异质性和分化谱系,并揭示了免疫耐受环境和胆囊癌发展和进展中的亚群。这些发现为进一步研究胆囊癌的特征和潜在的治疗靶点提供了新的思路。