RIP-seq analysis of eukaryotic Sm proteins identifies three major categories of Sm-containing ribonucleoproteins.
Sm 蛋白是一类高度保守RNA结合蛋白家族,广泛存在于生物界中。Sm蛋白在真核生物中由七个亚基组成,呈环状结构,能与相关的RNAs结合形成RNP(ribonucleoprotein,核糖核蛋白)。
We translate sequences to science and industry.
Sm 蛋白是一类高度保守RNA结合蛋白家族,广泛存在于生物界中。Sm蛋白在真核生物中由七个亚基组成,呈环状结构,能与相关的RNAs结合形成RNP(ribonucleoprotein,核糖核蛋白)。
7月31日,国际著名期刊Cell报道了关于肌肉细胞分化过程中miRNA对线粒体中蛋白翻译系统调控的最新研究成果,我公司首席科学家张翼博士参与了该项目的指导研究。
MicroRNA (miRNA)是一类长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子,通常情况下,它能与胞质中的mRNA的特定位点结合,导致mRNA的降解或抑制蛋白质的合成,但在特定细胞环境中,如血浆饥饿细胞,miRNA也能促进基因转录与表达。
腺苷酸N6位甲基化是高等真核生物最普遍的RNA修饰,虽然该修饰被发现与细胞的形态和发育相关,但其具体的调控方式却一直未被报道。2014年1月,Wang等人在Nature杂志上以letter的形式,首次报道了m6A调控基因表达的方式。该研究发现
m6A修饰的RNA可以被YTHDF2蛋白特异识别,被该蛋白结合会导致mRNA转运到p-body,从而导致mRNA的降解。因此m6A修饰可以调控mRNA的翻译和稳定性,在该修饰被发现近40年后,首次从机制上揭示了其调控方式。
人们的肠道中存在着大量微生物,正常粪便中有超过三分之一的物质是这些微生物的菌体。肠道菌群中不同菌种所占的比重,以及每个菌种所处的不同生活状态,都可能反映乃至影响人体的健康状态。肝硬化作为备受重视的全球性疾病。肝脏通过肝门以及胆汁分泌系统与肠道相通。肝硬化会对肠道微生物造成什么影响,而肠道菌群的变化,又如何左右肝硬化的病情发展?一篇最新的《Nature》论文对此进行了深入研究。
表观遗传调控是细胞核内染色体的高级组织形式,是目前干细胞研究领域的前沿和热点问题。包括胚胎干细胞和诱导干细胞在内的多功能干细胞都可以利用遗传学和表观遗传学的这种复杂网络,来维持自我更新和多向分化之间的精密平衡
circular RNA是mRNA剪接的特殊产物,是一类具有潜在重要调控功能的RNA。但到目前为止,人体内究竟有多少种circular RNA,这些circular RNA究竟有什么生物学功能,还是一个有待研究的问题。最近,Nature杂志发表了一篇题为“Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency”的文章,对任何小鼠体内的circular RNA进行了系统鉴定,并对其可能的生物学功能进行了研究。
哺乳动物个体包含至少400种细胞类型,这些细胞类型都具有一个相同的基因组,却具有独特的基因表达特征,从而具有不同的形态乃至生物学功能。不同细胞类型的特性是由转录调控决定的。目前为止我们还缺乏对生物体转录调控的全面的了解,直到最近 FANTOM 等几个团队联合发表了题为“A promoter-level mammalian expression atlas”的文章,通过CAGE-seq的方法对人和小鼠的转录起始位点(TSS)和启动子使用、转录因子调控进行了全面的描述。
科学家最近发现了一种潜在的新的植物沟通形式——寄生性植物菟丝子会与宿主植物交换大量的mRNA。
Subtelny等研究人员发表了题为“Poly(A)-tail profiling reveals an embryonic switch in translational control poly(A)”的文章,通过PAL-seq (poly(A)-tail profiling by sequencing) 技术研究了胚胎发育时期poly(A)尾巴长度与翻译效率的关系。相关成果公布在2014年1月29日Nature杂志上。
mRNA的3’ UTR区是转录后调控的主要区域,虽然线虫的基因组已被解析,同时有大量的转录组数据支持,但截至到2011年大部分线虫mRNA的准确的polyA位点尚无准确注释。
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