技术简介

外显子测序(Whole exome sequencing，WES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕获并富集后进行高通量测序的基因组分析方法，能够快速检测外显子(编码)和剪接位点变异,相比较全基因组测序更简便、经济和高效,其目标区域覆盖度更高,便于检出变异情况。外显子突变被证明是导致大多数单基因疾病的原因,在WES技术出现后的几年里，孟德尔病基因的鉴定大幅增加。除了在孟德尔疾病研究中的应用,目前一些复杂性疾病也应用外显子检测技术发现疾病的相关变异，例如癌症、心血管疾病、阿兹海默症、自身免疫性疾病等。

技术优势

✔  针对不同研究领域提供个性化方案；
✔  分析流程全备,数据解读详细,后期数据挖掘可提供个性化分析；
✔  采用主流的外显子捕获测序平台,数据可靠,稳定性好；
✔  提供多种变异分析:单核苷酸多态性、插入缺失、无义突变、结构变异、拷贝数变异。

技术流程

图1：建库原理
图2：数据分析流程

案例解析

▶ 全外显子组测序确定了与人类血浆代谢物相关的罕见遗传变异（Am J Hum Genet. IF=11.043)

该研究使用多种方法在蛋白质编码区选择和聚集罕见的遗传变异，并使用超高效液相色谱-串联质谱检测了它们与血浆中测定的995种代谢物的相关性。鉴定了40个新的涉及罕见编码变异的关联（27个基因和38个代谢物），其中28个（15个基因和28个代谢物）被复制。开发了一种算法来对每个位点上假定的驱动变异进行优先排序，并使用中介和孟德尔随机化分析来测试ACY1位点上代谢物和蛋白质水平的关联的方向性。总的来说，66%的报告关联涉及已批准的药物或生物活性药物样化合物的基因靶点，有助于药物靶点的验证努力。