BD Rhapsody单细胞平台采用独特的微孔板自然沉降技术结合刚性磁珠捕获单细胞,具有高通量低细胞损伤多组学整合分析核心优势,广泛应用于肿瘤、免疫、感染等研究领域,助力高分辨率解析细胞异质性及疾病机制。

技术优势

技术原理

1 细胞 – 磁珠配对:BD Rhapsody 微孔芯片(cartridge)通过重力沉降的方式,将单个细胞(Cell,蓝色)与单个带有条形码的磁珠(Barcoded bead,橙色)精准配对到微孔(Microwell)中 。

2 细胞裂解与 mRNA 结合:裂解细胞(Lysed cell),释放出的 mRNA 与磁珠上带有条形码的捕获寡核苷酸(capture oligos)进行杂交结合 。

3 磁珠回收:通过磁铁(图中红色 U 形磁铁示意)将结合了 mRNA 的磁珠回收至新的反应管中 。

cDNA 合成:以磁珠上结合的 mRNA 为模板,合成 cDNA 。

4 测序与分析:对合成的 cDNA 进行测序,构建单细胞基因表达谱。

文献案例

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常见Q&A

Q1:BD Rhapsody适合哪些类型的样本?

A:该平台兼容常规样本(如血液、肿瘤组织)及特殊样本,包括:

粒细胞:BD Rhapsody单细胞测序平台,以自然沉降的方式对单细胞进行分离捕获,没有额外的剪切力和试剂的刺激,对细胞更温和,能够高效地捕获各种类型的细胞,包括在其他平台容易丢失的粒细胞、肝实质细胞等。

植物原生质体:植物细胞制备成原生质体的过程中,容易产生细胞碎片及杂质,这对基于微流控技术的单细胞捕获平台而言,有堵孔风险。再者,在有压力、油相及破油剂刺激的情况下,植物原生质体容易发生应激反应,改变生理状态。BD Rhapsody单细胞平台通过自然沉降的方式捕获细胞,有效规避上述风险。

海洋生物:海洋生物通常适配高渗透压buffer,对基于微流控技术的单细胞捕获平台而言,会影响细胞捕获效率,而替换buffer又会降低反转录效率。BD Rhapsody单细胞平台兼容各类型的buffer,有效助力各种特殊样本类型的细胞捕获。

脑科学样本(如脑脊液、神经球):低细胞悬液浓度(可低至40个/μl)支持微量样本分析。

Q2:是否支持多样本混合检测?​

A:是的。平台采用样本标签(SMK)技术,允许一次性实现多个样本混合,降低实验成本。目前有成熟的人和小鼠的混样标签,并且已经推出不限物种以及细胞核的混样方案。

Q3:样本的细胞活性低是否能上机?​

A:BD Rhapsody微孔板技术依靠细胞重力自由沉降,适合处理难度高的临床样本,对细胞悬液的宽容度高。BD Rhapsody应对50%细胞活率的样本仍游刃有余,细胞碎片和红细胞对其稳定性的影响也非常有限。